新型冠状病毒导致的新型冠状病毒肺炎是当前全球关注的公共健康问题。新型冠状病毒(SARS-CoV-2)不仅传播迅速,而且具有致命性。截至2020年6月7日,新型冠状病毒已经感染超过700万人,并夺走了超过40万人的生命。
2020年4月3日,《纽约时报》著名专栏作家Carl Zimmer和《纽约时报》科学图形编辑Jonathan Corum发表了题为"Bad News Wrapped in Protein: Inside the Coronavirus Genome" 的文章。该文章将SARS-CoV-2编码的29种蛋白以模式图和简明易懂的文字呈现出来。
病毒必须感染进入活细胞才能进行复制和传播。当SARS-CoV-2病毒找到合适的细胞时,它会注入一条包含整个基因组的RNA链。SARS-CoV-2病毒的基因组不到30000个碱基,研究学者已经鉴定出基因组能够转录多达29种蛋白质。为学者们对其他冠状病毒的研究提供了了解SARS-CoV-2蛋白的途径。
SARS-CoV-2的基因组分为非结构基因和结构基因两个部分。其中约占SARS-CoV-2全基因组总长度三分之二的非结构基因含有两段编码蛋白质的序列,称为ORF1a和ORF1b;而紧随其后的结构基因区域则编码S(Spike)、E、M、N结构蛋白。
刺突蛋白(S 蛋白)承担病毒与宿主细胞膜受体结合及膜融合功能,是宿主中和抗体的重要作用位点以及疫苗设计的关键靶点。2019-nCoV 的Spike蛋白与人ACE2互作来感染人的呼吸道上皮细胞。
包膜蛋白(E蛋白)和膜蛋白(M蛋白)是冠状病毒高效组装的关键。
E蛋白
M蛋白参与病毒包膜的形成和出芽过程,即参与病毒的组装和病毒释放,抑制IFN攻击。两者可用于检测抗体。
SARS-CoV-2是一种正链RNA病毒,它的复制是由病毒非结构蛋白(nsp)的多亚基复制/转录复合物介导的。
SARS-CoV-2非结构基因中有两个大的重叠开放阅读框(ORF),分别是ORF1a和ORF1b。每个都有一个Orf1ab编码16个预测的Nsps(如图1),主要是负责编码与病毒复制、转录相关的酶。
非结构蛋白nsp3
蛋白来源:E.coli
蛋白标签:N-terminal 10xHis-tagged
蛋白纯度:Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.
非结构蛋白nsp5
Recombinant Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 3C-like proteinase(NSP5) (CSB-EP3389GND)
蛋白来源:E.coli
蛋白标签:N-terminal 10xHis-tagged
蛋白纯度:Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.
(Tris-Glycine gel) Discontinuous SDS-PAGE (reduced) with 5% enrichment gel and 15% separation gel.
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