非变性质谱分析（Native Mass Spectrometry, Native MS）作为一种先进的质谱技术，与传统的酶切质谱分析不同，能够在不破坏蛋白质天然构象的情况下，直接测定其质量、结构和翻译后修饰信息。通过温和的离子化过程，蛋白质在气相中保持其原有的高阶结构和多亚基组成，使得研究人员可以更准确地分析蛋白质复合物、相互作用以及蛋白质功能的调控机制。随着质谱技术的不断发展，Native MS 不仅在基础科研中发挥着重要作用，也为生物医学、药物研发及精准医学提供了新的研究工具。接下来我们将回顾非变性质谱分析的历史发展、技术突破和关键技术进展，探讨其在生物大分子研究中的应用前景。

一、发展历程

1、传统质谱分析的起步

在质谱技术发展初期，主要应用于小分子物质的定性和定量分析。直到20世纪70年代，质谱技术才逐步进入蛋白质分析领域。早期的蛋白质质谱分析通常依赖酶切（如胰蛋白酶）将蛋白质分解成肽段，再通过质谱仪对这些肽段进行检测，实现蛋白质的定性与定量。这种基于酶切的质谱方法在蛋白质组学的早期阶段发挥了重要作用，并为后续的技术革新奠定了基础。

2、非变性质谱分析的提出

尽管酶切质谱技术推动了蛋白质组学的发展，但其局限性也日益显现。例如，酶切过程往往会导致蛋白质空间结构信息和部分翻译后修饰（如磷酸化、糖基化等）的丢失。因此，如何在不破坏蛋白质天然状态的情况下进行分析，成为研究者关注的焦点。这一需求推动了非变性质谱分析技术的诞生，使得研究者能够跳过酶切步骤，直接分析完整的蛋白质分子，更全面地呈现蛋白质的天然信息。

3、非变性质谱的成熟与应用

随着高分辨率质谱仪器（如 Orbitrap 和 Q-TOF 质谱仪）的发展，非变性质谱分析能力显著提升。这些仪器能够在保持蛋白质天然结构的同时，精准识别其翻译后修饰信息。目前，Native MS 已从基础研究扩展至临床研究、药物开发等多个领域，成为蛋白质组学中不可或缺的重要工具。

二、关键技术

1、离子化技术

非变性质谱分析的核心挑战之一，是实现不破坏蛋白质天然构象的温和离子化。目前，主要采用电喷雾离子化（ESI），在特定应用中也可辅以基质辅助激光解吸/电离（MALDI），为后续高分辨率检测奠定基础。

（1）电喷雾离子化（ESI）：ESI 技术通过将溶液中的蛋白质样品喷射成带电的小液滴，实现温和离子化，较好地保留蛋白质的大分子结构，尤其适合复杂生物大分子的分析。ESI 因其温和特性，成为 Native MS 中最常用的离子化方式，能够有效避免蛋白质结构破坏。

（2）基质辅助激光解吸/电离（MALDI）：MALDI 通过激光照射样品表面，使蛋白质与基质分子共同解吸、离子化，形成带电分子离子。MALDI 适合分析大分子蛋白质，且样品处理简单，尽管其在 Native MS 中的使用较少，但在特定场景（如高通量筛选）仍具有优势。

2、高分辨率质谱技术

高分辨率质谱技术是非变性质谱分析的核心。通过高分辨率质谱，研究人员能够获得更加细致的质量/电荷比（m/z）信息，精确区分不同蛋白质分子及其翻译后修饰。最常用的高分辨率质谱仪有：

（1）Orbitrap质谱仪：Orbitrap质谱仪具有极高的分辨率和灵敏度，能够精确地分析复杂的蛋白质样品。它采用轴对称电场的工作原理，能够捕获离子并在较宽的质量范围内进行高精度的质量分析，特别适合进行非变性质谱分析。

（2）Q-TOF质谱仪：Q-TOF质谱仪结合了四极杆质谱和飞行时间质谱（TOF）的优点，能够提供高分辨率的质谱数据，特别适用于高通量蛋白质组学分析。Q-TOF质谱仪对复杂蛋白质样品的解析能力使其成为Native MS 中的常见选择。

3、数据分析与蛋白质鉴定

非变性质谱分析不仅要求高分辨率的质谱仪，还需要强大的数据分析平台。蛋白质组学数据分析的核心任务是从复杂的质谱数据中提取出准确的蛋白质信息，并鉴定翻译后修饰。

（1）质谱数据解析：非变性质谱分析产生的数据量庞大，需要通过专门的软件（如MaxQuant、Proteome Discoverer等）进行后处理。软件能够根据实验数据中的质量和相对丰度信息，识别蛋白质的氨基酸序列、空间结构及其修饰信息。对于翻译后修饰的分析，尤其需要开发和优化特定的算法来提取修改后的肽段信息。

（2）数据库匹配与定量分析：通过与已知的蛋白质数据库进行比对，结合质谱数据中的m/z值、肽段丰度等信息，能够对蛋白质进行准确的鉴定和定量。对于翻译后修饰的分析，除了氨基酸序列外，还需要分析修饰位点和修饰类型。

4、无酶样品制备与预处理技术

与传统的酶切方法不同，非变性质谱分析不依赖酶切步骤，因此样品制备过程对分析结果至关重要。为了避免蛋白质降解或结构变化，研究者通常需要在严格控制条件下进行样品的预处理，包括冷冻保存、去污剂使用、抗氧化剂添加等。此外，为了提高分析效率，常用的方法包括液-液提取、亲和色谱、反向相色谱等，这些技术能够有效纯化目标蛋白或蛋白质复合物，为Native MS提供高质量的样品。

非变性质谱分析的出现突破了传统酶切质谱分析的局限，使得研究人员可以在保持蛋白质天然状态的前提下，揭示更多的生物学信息。从离子化技术到高分辨率质谱分析，再到数据处理与分析，它的每一项技术进展都推动着蛋白质组学领域的发展。随着仪器技术、数据分析方法和样品制备技术的不断优化，它将在未来的蛋白质组学研究中发挥更大的作用，特别是在复杂蛋白质的解析、翻译后修饰的深入研究和生物标志物的发现等方面，具有广阔的应用前景。百泰派克为您提供高质量的分析服务，欢迎与我们联系！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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